課程資訊
課程名稱
生物資訊學
BIOINFORMATIC 
開課學期
97-2 
授課對象
生命科學院  漁業科學研究所  
授課教師
林仲彥 
課號
FishSc5036 
課程識別碼
B45 U1370 
班次
 
學分
全/半年
半年 
必/選修
選修 
上課時間
星期二5,6(12:20~14:10) 
上課地點
 
備註
上課教室:生科館 4B與阮雪芬合開
限碩士班以上
總人數上限:25人 
Ceiba 課程網頁
http://ceiba.ntu.edu.tw/972bioinfo 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

本課程主在介紹現今在生物資訊領域的相關知識. 課程內容包括: Introduction, Biological Databases, Analysis at the Nucleotide and Protein Level, Inferring Relationships等
1. Introduction
2. Biological Databases I: Sequence Databases
3. Biological Databases II: Mapping Databases
4. Biological Databases III: Information Retrieval from Biological Databases
5. Analysis at the Nucleotide Level I: Predictive Methods Using DNA Sequences
6. Analysis at the Nucleotide Level II: Predictive Methods Using RNA Sequences
7. Analysis at the Nucleotide Level III: Sequence Polymorphisms
8. Analysis at the Protein Level I: Predictive Methods Using Protein Sequences
9. Analysis at the Protein Level II: Protein Structure Prediction and Analysis
10. Analysis at the Protein Level III: Intermolecular Interactions and Biological Pathways
11. Inferring Relationships I: Assessing Pairwise Sequence Similarity: BLAST and FASTA
12. Inferring Relationships II: Creation and Analysis of Protein Multiple Sequence Alignment
13. Inferring Relationships III: Phylogenetic Analysis
14. Inferring Relationships IV: Using DNA Microarrays to Assay Gene Expression
15. Inferring Relationships V: Proteomics and Protein Identification
16. Drug Discovery and Bioinformatics
 

課程目標
希望訓練學生利用生物資訊工具及知識進行其它課程的資料收集及分析 
課程要求
 
預期每週課後學習時數
 
Office Hours
 
指定閱讀
 
參考書目
 
評量方式
(僅供參考)
   
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
  Introduction (阮雪芬) 
第2週
  Biological Databases I: Sequence Databases (阮雪芬) 
第3週
  Biological Databases II: Mapping Databases (阮雪芬) 
第4週
  Biological Databases III: Information Retrieval from Biological Databases (阮雪芬) 
第5週
  Biological Databases IV: Genomics Databases & Analysis at the Nucleotide Level I: Predictive Methods Using DNA Sequences (阮雪芬) 
第6週
  Analysis at the Nucleotide Level II: Predictive Methods Using RNA Sequences (阮雪芬) 
第7週
  Analysis at the Nucleotide Level III: Sequence Polymorphisms (阮雪芬) 
第8週
  Application of Bioinformatics to Biomedical Research (阮雪芬) 
第9週
  期中考週 
第10週
  Analysis at the Protein Level I: Predictive Methods Using Protein Sequences (林仲彥) 
第11週
  Analysis at the Protein Level II: Protein Structure Prediction and Analysis (林仲彥) 
第12週
  Analysis at the Protein Level III: Intermolecular Interactions and Biological Pathways (林仲彥) 
第13週
  Inferring Relationships I: Assessing Pairwise Sequence Similarity: BLAST and FASTA (林仲彥) 
第14週
  Inferring Relationships II: Creation and Analysis of Protein Multiple Sequence Alignment (林仲彥) 
第15週
  Inferring Relationships III: Phylogenetic Analysis (林仲彥) 
第16週
  Inferring Relationships IV: Using DNA Microarrays to Assay Gene Expression (林仲彥) 
第17週
  Inferring Relationships V: Proteomics and Protein Identification (林仲彥) 
第18週
  期末考週